公司堅持“在保護中開發、在開發中保護”的方針，在礦產資源開發和生態環境保護中以最少的礦產資源消耗支撐經濟社會持續發展。截至2023年，云天化已有七座礦山被評為國家級綠色礦山。旗下磷化集團自1984年起進行礦山復墾植被，累計面積超過了5.6萬畝，被評為“全國土地復墾先進單位”、“全國環境保護先進單位”。

公司推行“綠色全量資源化”的磷產業開發模式，攻克了中低品味膠磷礦浮選產業化的世界性難題，其磷礦資源利用率大于97%，技術上全球領先，使云天化磷礦更清潔，植物吸收利用率高。